【由来】
二百多年前，人们就利用沟中水流开设了水磨，因而得名水磨沟。1956年水磨沟改属工矿区。1961年，水磨沟工矿区和八道湾镇合并成立水磨沟区。
【沿革】
该区原属迪化县，1944年后，划归迪化市管辖。1949年新疆和平解放成立迪化市人民政府后，水磨沟属市辖七个区中的第五区。1953年11月20日迪化市更名为乌鲁木齐市。1956年经自治区人委批准，水磨沟属工矿区。1961年，水磨沟工矿区和八道湾镇合并成立水磨沟区，1969年4月改名水磨沟区革命委员会。1980年成立水磨沟区人民政府，隶属乌鲁木齐市。（一说，1956年为第四区，1960年与八道湾镇合并为水磨沟工矿区，1960年成立景泉公社，1968年更名水磨沟区。）
