【由来】
明万历年间(1573年—1620年七月)，成吉思汗弟哈布图哈萨尔第十五世孙博第达喇将科尔沁部以河划界，分给自己的儿子们做牧地，其九子阿敏分得嫩江以西的绰尔河流域，始号扎赉特部。据《满洲地名考》：“扎赉”为“洼地”之意。清顺治五年(1648年)，叙功追封固山贝子改扎赉特部为扎赉特旗建制。
【沿革】
铁木真称汗前，曾将其帐殿护卫(弓箭手)编为科尔沁，由其弟哈布图哈萨尔亲自指挥。明洪武二十二年(1389年)以朵颜元帅府置朵颜卫，因朵颜山得名。今扎赉特旗属朵颜卫辖境。永乐四年(1406年)置木塔里山卫，治今乌兰浩特市北公主陵附近，后废。明万历年间(1573年—1620年七月)，成吉思汗弟哈布图哈萨尔第十五世孙博第达喇将科尔沁部以河划界，分给自己的儿子们做牧地，其九子阿敏分得嫩江以西的绰尔河流域，始号扎赉特部。
后金天命九年(1624年)，阿敏子蒙衮随科尔沁台吉奥巴降后金，赐号达尔汗和硕齐，徙牧于嫩江西岸。顺治五年(1648年)，叙功追封固山贝子改扎赉特部为扎赉特旗建制，属哲里木盟。
民国元年(1912年)中华民国成立，哲里木盟10旗归北洋政府蒙藏院管辖，同时受东三省监督和节制。民国二十年(1931年)“九一八”事变后，日军入侵中国东北。民国二十一年(1932年)3月9日，日本扶植溥仪建立伪满洲国后，撤销哲里木盟，改设兴安南分省。扎赉特旗隶属于伪兴安省的兴安南分省。民国二十三年(1934年)，伪兴安南分省改兴安南省，归蒙政部管辖。民国三十二年(1943年)，兴安南省改称兴安南地区，隶属于兴安总省。
民国三十四年(1945年)8月15日，日本无条件投降，伪满洲国垮台。9月，国民政府设置兴安省，扎赉特旗属之。民国三十五年(1946年)1月16日，成立东蒙自治政府，同时成立中共兴安省政府，上属东蒙自治政府，下辖五旗一街：西科前旗、西科中旗、西科后旗、喜扎嘎尔旗、扎赉特旗、王爷庙街。民国三十六年(1947年)5月1日，内蒙古自治政府成立。5月25日，中共兴安省撤销，其辖区划为内蒙古自治政府直辖区。民国三十七年(1948年)11月2日，沈阳解放，国民政府的兴安省政府灭亡。11月15日，中共成立内蒙古自治政府兴安盟，盟府驻王爷庙。时辖科尔沁右翼前旗，科尔沁右翼中旗、西科后旗、扎赉特旗、喜扎嘎尔旗。
1953年1月23日，撤销东部呼纳、兴安、哲里木等盟，保留昭乌达盟，合并成立内蒙古东部行政公署(驻乌兰浩特市)。扎赉特隶属东部行政公署。1954年5月21日，撤销内蒙古自治区东部区行政公署，恢复哲里木盟。将原兴安盟与呼纳盟合并，改为呼伦贝尔盟，扎赉特旗属呼伦贝尔盟。1969年7月5日，扎赉特旗随呼伦贝尔盟划归黑龙江省。1979年7月1日，扎赉特旗随呼伦贝尔盟复归内蒙古自治区。1980年7月26日，恢复兴安盟建制，扎赉特旗隶属兴安盟。
