【由来】
乾隆年间在此设军台，称巴尔楚克台。清光绪九年（1883年）在此置玛喇巴什直隶厅，光绪二十九年（1903年）直隶厅改设为州，称巴楚州，1913年改设巴楚县。
巴楚，是巴尔楚克的简称。《西域图志》作巴尔楚克，《西陲要略》作巴里楚克。据《西域同文志》释：“巴尔楚克，全有也。地饶水草，故名。”维吾尔语称作玛热勒巴什，旧有玛喇巴什、毛拉巴什等不同译名，意为鹿首。
【沿革】
巴楚在汉代属古西域三十六国之一的尉头国地。三国魏晋时属龟兹。隋朝时属疏勒。唐代置安西都护府，巴楚为其属下的尉头州。宋朝是哈拉汗王朝和西辽王朝的属地。元朝属别失八里行尚书省。明朝是察合台汗国的辖地，后属准噶尔。
清乾隆二十六年（1761年）设叶尔羌办事大臣，巴楚归叶尔羌管辖，是阿克苏与叶尔羌、喀什噶尔间的军事、交通重镇。清光绪三年冬（1877年）清军刘锦棠率部平定阿古柏之乱，驻扎在巴尔楚克。乾隆年间设军台，称巴尔楚克台，为叶尔羌到阿克苏十六军台之一。道光十二年（1832年）筑玛拉巴什城。
清光绪九年（1883年）在此置玛喇巴什直隶厅，属喀什噶尔道。光绪二十九年（1903年）直隶厅改设为州，称巴楚州，隶莎车府，下辖八大庄。
1913年改设巴楚县，属喀什噶尔道。1922年由巴楚县析置麦盖提县。1929年巴楚县属喀什行政区，1943年属喀什督察专区。
1949年后，巴楚县属喀什专区。1954年，归南疆行署管辖。1956年，南疆行署撤销，莎车专区并入喀什专区，巴楚县复归重新成立的喀什专员公署领导。1958年属喀什专区。1971年1月喀什专区改为喀什地区，巴楚县隶属喀什地区至今。
