【由来】
1940年从乌什县析置阿合奇设治局，因治所在阿合奇（今哈拉奇乡阿合奇村），故名。1944年改县。阿合奇，系柯尔克孜语，意为“白芨芨草”，因过去有大面积的芨芨滩，故名。
【沿革】
汉朝初时为尉头国地。汉代先后属西域都护府和西域长史府，魏晋南北朝时为龟兹国地。隋唐并入疏勒地，唐置尉头州，宋仍称疏勒，元、明两代属别失八里的西境，后曾一度并于准噶尔，地名图尔满。
清乾隆二十四年（1759）为乌叶办事大臣所辖。光绪九年（1883年）置乌什直隶厅，隶属阿克苏道。
民国二年（1913年）乌什直隶厅改称乌什县，阿合奇（当时称阔克夏勒，柯语含义为荒凉边远之地）仍归乌什县管辖。1940年从乌什县析置阿合奇设治局，因治所在阿合奇（今哈拉奇乡阿合奇村），故名。1941年治所由阿合奇东迁到吾曲（旧刊新疆舆图乌什厅图作巫区），即今阿合奇县城。1944年升为县，属阿克苏专区。1954年划入当年成立的克孜勒苏柯尔克孜自治州。
